Setelahnya, pada tahun 2009 dengan terinspirasi dari slogan Barrack Obama yakni ‘Yes We Can’, dia pun membuat yayasan Kitong Bisa untuk fokus mengurusi pendidikan anak-anak di Papua.
“Bagaimana kita dapat membantu orang lain untuk mengejar mimpi mereka. Kita bertanggung jawab terhadap orang lain untuk bagaimana mewujudkan mimpi mereka. Itu tanggung jawab kita sebagi anak bangsa,” tuturnya.
Hingga akhirnya dia pun terpilih menjadi Staf Khusus Presiden Joko Widodo (Jokowi). Billy mengaku sempat berfikir terlebih dahulu apakah akan menerima, karena dia khawatir tak bisa secara maksimal mengurusi yayasan Kitong Bisa.
Ia pun akhirnya menerima tawaran tersebut, setelah sang ayah mendorongnya agar menerima jabatan stafsus presiden Jokowi. Dikarenakan sang ayah menilai sudah waktunya Billy untuk membantu mewujudkan mimpi masyarakat Indonesia.