Pada saat itu, perang antar desa biasa terjadi, dan Michael mengetahui bahwa prajurit Asmat sering mengambil kepala musuh mereka dan memakan daging mereka. Di daerah-daerah tertentu, laki-laki Asmat akan melakukan ritual seks homoseksual, dan dalam ritual ikatan, mereka terkadang saling minum air seni.
"Sekarang ini adalah negara yang liar dan entah bagaimana lebih terpencil daripada yang pernah saya lihat sebelumnya," tulis Michael dalam buku hariannya.
Ketika misi kepanduan awal selesai, Michael diberi energi. Dia menuliskan rencananya untuk membuat studi antropologis rinci tentang Asmat dan menampilkan koleksi seni mereka di museum ayahnya.
Michael berangkat sekali lagi ke Papua Nugini pada 1961, kali ini ditemani oleh René Wassing, seorang antropolog pemerintah.
Saat perahu mereka mendekati Otsjanep pada tanggal 19 November 1961, badai tiba-tiba menghantam. Kapal yang dinaiki Michael terbalik, membuat dia Wassing menempel di lambung kapal yang terbalik.
Mereka berada 12 mil dari pantai. Michael dilaporkan memberi tahu antropolog lain bahwa dia bisa melompat ke air. Sejak saat itu, dia tidak pernah terlihat lagi.