Pada 1986, dia bertemu dengan istrinya, putri Masako Owada di sebuah pesta teh.
Putri Masako yang merupakan warga biasa Jepang, akhirnya menerima lamaran Naruhito setelah sang putra mahkota berujar: "Kamu mungkin takut dan khawatir bergabung dengan keluarga kekaisaran. Tetapi aku akan melindungi sepanjang waktu."
Mereka menikah pada 1993.
Sang putri, yang dilaporkan menderita gangguan stres, mengakui pada bulan Desember bahwa ia merasa "tidak aman" menjadi permaisuri , tetapi berjanji untuk melakukan yang terbaik demi melayani rakyat Jepang.
Masako menjalani pendidikan di Harvard dan Oxford, dan memiliki karir yang menjanjikan sebagai diplomat sebelum menikah.
Satu-satunya anak pasangan itu, Putri Aiko, lahir pada tahun 2001. Namun, hukum Jepang saat ini membatasi perempuan untuk mewarisi takhta sehingga dia bukan pewaris ayahnya.
Saudara laki-laki Naruhito, Pangeran Fumihito akan berada di urutan berikutnya, diikuti oleh keponakan kaisar baru, Pangeran Hisahito yang saat ini masih berusia 12 tahun.
Mengapa monarki Jepang penting?