3. Kopassus
Komando Pasukan Khusus (Kopassus) adalah pasukan elite milik TNI AD yang pernah terjun memburu KKB di Papua. Pada Mei 2021 lalu, anggota Kopassus terlibat kontak senjata dengan anggota KKB di wilayah kampung Wuloni, Illaga.
Dalam kejadian itu, 2 anggota KKB dinyatakan tewas. Sementara itu, pada tahun 2017 lalu Kopassus pernah terlibat dalam operasi senyap di Tembagapura.
Kegiatan ini dilakukan bersama dengan tim Intai Kostrad. Keduanya berhasil membebaskan sandera di Banti dan Kimberli, Tembagapura.
Selain melepaskan lebih dari 300 masyarakat sipil, operasi ini juga merupakan upaya guna merebut kampung Kimberli dari cengkeraman KKB.
4. Para Raider 431/SSP
Satuan elite lainnya milik TNI yang ditugaskan memburu KKB di Papua adalah Para Raider 431/Satria Setia Perkasa (SSP). Pada 2021 lalu, pasukan ini diterjunkan khusus untuk memburu anggota KKB yang menembak salah satu anggota Brimob, Bharatu Bachtiar Yuniwandaru.
Pasukan elite berkualitas mumpuni ini bermarkas di Kariango, Sulawesi Selatan, dan masuk dalam Divisi 3 Kostrad. Selain di Papua, Para Raider 431/SSP juga pernah mendapat amanat untuk bertugas di Irian Jaya, Timor-Timor, dan operasi Aceh tahun 2002 sampai 2003.