Di Tengah Kebimbangan, Sholat Istikharah Menuntun Subagyo Jadi Jenderal Kopassus
Seiring waktu, Subagyo dipercaya menjadi Komandan Satuan Pengamanan (Dansatpam) Pasukan Pengawal Presiden (Paswalpres). Dua tahun menjabat Dansatpam Palwapres Subagyo diangkat menjadi Komandan Grup A Paspampres.
Sembilan tahun betugas di lingkaran Istana Kepresidenan membuat Subagyo menjadi orang dekat Presiden Soeharto. Penugasannya itu memberikan sinar bagi karier di TNI karena selalu berdekatan dengan orang nomor satu di Tanah Air.
Subagyo dipindah menjadi Paban D-2 Bais pada 1993. Setahun bertugas, Subagyo diangkat menjadi Kepala Pengamanan dan Sandi Angkatan Darat (Kadispamsanad).
Pengangkatan tersebut membuat Subagyo menjadi satu-satunya lulusan Akmil 1970 yang menyandang pangkat jenderal. Subagyo kemudian dipercaya menjadi Komandan Jenderal (Danjen) Kopassus, padahal baru tiga bulan menyandang pangkat Brigjen TNI.
Setelah memimpin pasukan Korps Baret Merah, Subagyo selanjutnya diangkat menjadi Pangdam IV/Diponegoro. Pangkat Subagyo naik menjadi Mayor Jenderal (Mayjen) TNI.
