Salah satu masalah utama yang diangkat adalah impunitas aparat keamanan. Jarang sekali ada hukuman bagi pelaku pelanggaran HAM, menciptakan budaya impunitas yang memperburuk diskriminasi dan kekerasan. Ketidakadilan ini membuat masyarakat minoritas kehilangan kepercayaan terhadap sistem hukum—banyak korban enggan melaporkan kasus karena takut balasan atau yakin tidak akan ada tindak lanjut.
Pelanggaran HAM yang sistematis berdampak luas terhadap kehidupan sosial dan politik Pakistan. Penindasan terhadap kelompok etnis memperkuat gerakan separatis dan memperlemah integrasi nasional, sementara diskriminasi agama memperdalam jurang perpecahan sosial yang memicu konflik horizontal. Pakistan juga menghadapi kritik tajam dari komunitas internasional, termasuk PBB dan organisasi HAM global, yang berdampak pada citra internasionalnya.